Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLT4P35916 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLT4P35916 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLT4P35916 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FLT4P35916 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms