Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms