Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms