Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms