Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARID4AP29374 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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