Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD1P28340 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD1P28340 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms