Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP1P23763 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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