Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALB2P22676 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CALB2P22676 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CALB2P22676 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALB2P22676 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALB2P22676 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms