Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF1P22415 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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