Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB4AP20338 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4AP20338 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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