Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms