Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAV1P15498 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAV1P15498 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms