Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms