Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BMP4P12644 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms