Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK4P11802 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK4P11802 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK4P11802 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK4P11802 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms