Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGAMP11215 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms