Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD8BP10966 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms