Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms