Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF3P09919 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms