Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB2P05107 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms