Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms