Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIN3BO75182 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIN3BO75182 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms