Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSVO60911 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms