Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL41O60662 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms