Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms