Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD6O43541 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms