Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMC8O43402 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms