Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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