Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBDO15205 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms