Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms