Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3AO14802 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms