Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms