Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DXG7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DXG7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms