Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms