Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms