Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms