Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms