Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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