Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms