Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNA3Q9UI47 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms