Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms