Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms