Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms