Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COMMD8Q9NX08 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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