Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms