Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX5Q9H2C1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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