Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms