Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms