Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms