Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A9Q9BXP2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A9Q9BXP2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms